این آزمایشگاه در طبقه دوم گروه زمین شناسی واقع است. راه اندازی این آزمایشگاه در سال 1400 و تجهیز آن در سالهای اخیر صورت گرفته است به طوری که مطالعات پژوهشی و پروژه های تحقیقاتی در این مکان صورت می پذیرد
عمده مطالعات در این آزمایشگاه در خصوص کانی شناسی، پتروگرافی، رخساره های میکروسکوپی، نمونه های ایزوله، مطالعات پژوهشی و سنگ شناسی می باشد
این آزمایشگاه مجهز به میکروسکوپ های پیشرفته دومنظوره و بیناکولار به منظور مطالعه مقاطع نازک میکروسکوپی، مقاطع صیقلی، نمونه های ایزوله، جداسازی کانی ها و غیره می باشد.